Просмотр кода страницы Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы

[[Файл:Adenosine diphosphate ribose.svg|thumb|[[АДФ-рибоза]]]]
[[Файл:NAD+.svg|thumb|[[Никотинамидадениндинуклеотид]]]]
'''Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы''' ('''PARP''') — [[ферменты]], катализирующие поли-[[АДФ-рибозилирование]], один из видов [[Посттрансляционная модификация|посттрансляционной модификации]] белков. 

Поли(АДФ-рибоза)-полимеразы ([[Шифр КФ|КФ 2.4.2.30]] в Международной классификации ферментов) относятся к подклассу пентозилтрансфераз (КФ 2.4.2) класса [[гликозилтрансферазы|гликозилтрансфераз]] (КФ 2.4)<ref>{{Cite web |url=http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/4/2/30.html |title=EC 2.4.2.30 // IUBMB Enzyme Nomenclature |access-date=2013-05-14 |archive-date=2013-06-20 |archive-url=https://web.archive.org/web/20130620144022/http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/EC2/4/2/30.html |deadlink=no }}</ref> и катализируют реакцию переноса АДФ-рибозила (остатка [[аденозиндифосфат]]-рибозы) на поли-АДФ-рибозильную цепь, связываемую с белком, в которой донором АДФ-рибозы является [[никотинамидадениндинуклеотид]] (НАД<sup>+</sup>)<ref>{{cite journal | year = 2020 | last1 = Нилов | first1 = ДК | last2 = Пушкарев | first2 = СВ | last3 = Гущина | first3 = ИВ | last4 = Манасарян | first4 = ГА | last5 = Кирсанов | first5 = КИ | last6 = Швядас | first6 = ВК | title = Моделирование фермент-субстратных комплексов поли(ADP-рибозо)полимеразы 1 человека | volume = 85 | pages = 116-125 | journal = Биохимия | doi=10.31857/S0320972520010091}}</ref>:
: НАД<sup>+</sup> + (АДФ-D-рибозил)<sub>n</sub>-Акцептор <math>\to</math> (АДФ-D-рибозил)<sub>n+1</sub> + [[никотинамид]]
Акцепторами для разных PARP являются разные белки-субстраты, вследствие чего эти ферменты имеют различные физиологические функции<ref>Piskunova TS, Yurova MN, Ovsyannikov AI, Semenchenko AV, Zabezhinski MA, Popovich IG, Wang ZQ, Anisimov VN. Deficiency in Poly(ADP-ribose) Polymerase-1 (PARP-1) Accelerates Aging and Spontaneous Carcinogenesis in Mice. Curr Gerontol Geriatr Res. 2008:754190. Epub 2008 Apr 14. PMID 19415146</ref><ref>Espinoza LA, Smulson ME, Chen Z. Prolonged poly(ADP-ribose) polymerase-1 activity regulates JP-8-induced sustained cytokine expression in alveolar macrophages. Free Radic Biol Med. 2007 May 1;42(9):1430-40. Epub 2007 Feb 1. PMID 17395016</ref><ref>Zerfaoui M, Suzuki Y, Naura AS, Hans CP, Nichols C, Boulares AH. Nuclear translocation of p65 NF-kappaB is sufficient for VCAM-1, but not ICAM-1, expression in TNF-stimulated smooth muscle cells: Differential requirement for PARP-1 expression and interaction. Cell Signal. 2008 Jan;20(1):186-94. Epub 2007 Oct 12. PMID 17993261</ref>. В отличие от PARP, которые используют для модификации одного акцептора несколько молекул НАД<sup>+</sup> и синтезируют поли-АДФ-рибозу, ферменты, катализирующие моно-АДФ-рибозилирование, не относятся к суперсемейству PARP и имеют в номенклатуре ферментов другой порядковый номер.

Наиболее известным представителем суперсемейства является фермент PARP-1, участвующий в [[Репарация ДНК|репарации]] повреждений [[ДНК]] и ремоделировании [[хроматин]]а за счет поли-АДФ-рибозилирования гистонов. Поскольку при [[апоптоз]]е ДНК подвергается расщеплению, [[каспазы]] расщепляют и тем самым инактивируют PARP-1, предотвращая репарацию расщепляемой ДНК.

== Клиническое значение и ингибиторы PARP ==
В некоторых случаях нарушения в комплексе репарации ДНК приводят к [[канцерогенез]]у. Так, например, у человека мутации [[Ген-супрессор опухолей|генов-онкосупрессоров]] [[BRCA1]] и [[BRCA2]] ({{lang-en|breast cancer susceptibility protein}}), кодирующих белки, участвующие в репарации ДНК, ведут к возникновению [[Рак молочной железы|рака молочной железы]]. Подавление активности PARP-1 при химиотерапии в этом случае ведет к апоптозу клеток, ДНК которых повреждена [[Цитостатические препараты|цитостатическими препаратами]]<ref>{{статья
|issn=1449-1907
|том=3
|номер=4
|страницы=117—123
|заглавие=PARP-1 inhibitors: are they the long-sought genetically specific drugs for BRCA1/2-associated breast cancers?
|издание={{Нп3|International Journal of Medical Sciences}}
|accessdate=2013-03-29
|ссылка=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1525219/
|язык=en
|тип=journal
|автор=Joseph A.; De Soto; Chu-Xia Deng
|число=15
|месяц=7
|год=2006
|archivedate=2022-07-09
|archiveurl=https://web.archive.org/web/20220709142727/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1525219/
}}</ref>. В настоящее время ряд ингибиторов PARP ([[велипариб]], [[инипариб]], [[олапариб]], [[рукапариб]]) проходят клинические испытания в качестве противораковых препаратов.

== Гены PARP человека и кодируемые ими ферменты ==
У человека имеется 16 генов, кодирующих эти ферменты, образующие одно суперсемейство<ref>{{Cite web |url=http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bies.20085/abstract;jsessionid=75BEADC7A0B6BD8E1ED5D9CF66C6E299.d01t02 |title=Ame J. C., Spenlehauer C., de Murcia G. The PARP superfamily. Bioessays 2004; 26: 882—893. |access-date=2010-08-30 |archive-date=2016-03-05 |archive-url=https://web.archive.org/web/20160305104958/http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bies.20085/abstract;jsessionid=75BEADC7A0B6BD8E1ED5D9CF66C6E299.d01t02 |deadlink=no }}</ref><ref>{{cite journal | pmid = 33801950 | year = 2021 | last1 = Manasaryan | first1 = G | last2 = Suplatov | first2 = D | last3 = Pushkarev | first3 = S | last4 = Drobot | first4 = V | last5 = Kuimov | first5 = A | last6 = Švedas | first6 = V | last7 = Nilov | first7 = D | title = Bioinformatic analysis of the nicotinamide binding site in poly(ADP-ribose) polymerase family proteins | volume = 13 | pages = 1201 | journal = Cancers | doi=10.3390/cancers13061201}}</ref>, все они имеют гомологичный каталитический домен и, по-видимому, происходят от одного предкового фермента.
{| class="wikitable"
|-
! Ген
! Хромосома
! Код доступа в базе данных UniProt
! Максимальная длина полипептида (а.о.)<sup>*</sup>
! Максимальная расчетная масса продукта (кДа)<sup>*</sup>
! Альтернативные наименования продукта
! Домены, кроме каталитического
! Примечания
|-
! ''PARP-1''
| 1q41-42
| [http://www.uniprot.org/uniprot/P09874 P09874] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/P09874 |date=20110412150857 }}
| 1014
| 113
| ADPRT, PPOL
| BRCT, PARP-регуляторный, ДНК-связывающий
| 
|-
! ''PARP-2''
| 14q11.2
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q9UGN5 Q9UGN5] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q9UGN5 |date=20110412150848 }}
| 583<sup>*</sup>
| 66<sup>*</sup>
| ADPRT2, ADPRTL2
| PARP-регуляторный
| 
|-
! ''PARP-3''
|   3p21
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q9Y6F1 Q9Y6F1] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q9Y6F1 |date=20101114015340 }}
| 533
| 60
| ADPRT3, ADPRTL3
|
|  
|-
! ''PARP-4''
|  13q11
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q9UKK3 Q9UKK3] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q9UKK3 |date=20110821115403 }}
| 1724
| 193
| ADPRTL1, KIAA0177, PARPL, VPARP
| BRCT, VIT, VWFA
| 
|-
! ''PARP-5a''
|  8p23.1
| [http://www.uniprot.org/uniprot/O95271 O95271] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/O95271 |date=20110119044902 }}
| 1327<sup>*</sup>
| 142<sup>*</sup>
| TNKS1, танкираза 1
| анкириновый, SAM
| 
|-
! ''PARP-5b''
| 10q23.03
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q9H2K2 Q9H2K2] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q9H2K2 |date=20100621101916 }}
| 1166
| 127
| TNKL, TNKS2, танкираза 2
| анкириновый, SAM
|  
|-
! ''PARP-6''
| 15q22.3  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q2NL67 Q2NL67] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q2NL67 |date=20100806040204 }}
| 630<sup>*</sup>
| 71<sup>*</sup>
|  
|  
| обнаружен транскрипт, белок неохарактеризован
|-
! ''PARP-7''
| 3q25.31  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q7Z3E1 Q7Z3E1] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q7Z3E1 |date=20110511152147 }} 
| 657
| 76
| TIPARP
| ДНК-связывающий, WWE
|  
|-
! ''PARP-8''
| 5q11.2  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q8N3A8 Q8N3A8] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q8N3A8 |date=20121104221729 }}
| 854<sup>*</sup>
| 96<sup>*</sup>
|  
|  
|  
|-
! ''PARP-9''
| 3q13-q21  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q8IXQ6 Q8IXQ6] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q8IXQ6 |date=20100806144935 }}
| 854<sup>*</sup>
| 96<sup>*</sup>
| BAL
| macro
| 
|-
! ''PARP-10''
| 8q24.3  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q53GL7 Q53GL7] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q53GL7 |date=20121103071016 }}
| 1025
| 110
|  
|  
|  
|-
! ''PARP-11''
| 12p13.3  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q9NR21 Q9NR21] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q9NR21 |date=20100806151713 }}
| 331<sup>*</sup>
| 39<sup>*</sup>
| C12orf6
| WWE
|  
|-
! ''PARP-12''
|  7q34   
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q9H0J9 Q9H0J9] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q9H0J9 |date=20121025190215 }}
| 701
| 79
| ZC3HDC1
| ДНК-связывающий, WWE
|  
|-
! ''PARP-14''
| 3q21.1  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q460N5 Q460N5] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q460N5 |date=20121110134812 }}
| 1720<sup>*</sup>
| 194<sup>*</sup>
| BAL2, KIAA1268
| macro, WWE
|  
|-
! ''PARP-15''
| 3q21.1  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q460N3 Q460N3] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q460N3 |date=20121110134909 }}
| 656<sup>*</sup>
| 73<sup>*</sup>
| BAL3
| macro
|  
|-
|-
! ''PARP-16''
|  15q22.2  
| [http://www.uniprot.org/uniprot/Q8N5Y8 Q8N5Y8] {{Wayback|url=http://www.uniprot.org/uniprot/Q8N5Y8 |date=20121110134935 }}
| 322<sup>*</sup>
| 36<sup>*</sup>
| C15orf30
|  
| обнаружен транскрипт, белок неохарактеризован
|}

<sup>*</sup>Обозначены продукты генов, для которых также известны изоформы меньшей длины и молекулярной массы.

== Примечания ==
{{примечания}}


== Ссылки ==
* [http://www.bioreagents.com/products/productDetails/productDetails.cfm?catnbr=PA3-951 Entry for a PARP immunoassay] at bioreagents.com
* [https://web.archive.org/web/20060509132228/http://www.inotekcorp.com/content/parp.asp PARP — Poly (ADP-ribose) polymerase] at inotekcorp.com
* [https://web.archive.org/web/20060502012700/http://parplink.u-strasbg.fr/index.html The PARP Link Homepage] at parplink.u-strasbg.fr
* {{MeshName|Poly+ADP+Ribose+Polymerase}}
* [http://www.parp-inhibitors.com/ Parp Inhibitors] {{Wayback|url=http://www.parp-inhibitors.com/ |date=20100328132947 }} Information Site
* [https://web.archive.org/web/20100428052309/http://www.trevigen.com/dnadamage/parp.php PARP Activity and Inhibition Assays] at trevigen.com

{{Репарация ДНК}}

[[Категория:Трансферазы|*]]